ミレニアム復活ゴジラ第2弾。ゴジラ映画に愛着を抱く新鋭・手塚昌明監督の手腕と、鈴木健二特技監督の大胆なアングルによる特撮シーンが見事に融合した、シリーズ久々の快作。女性たちの活躍を強く印象づけるヒロイン映画として映えており、音楽・大島ミチルのダイナミズム極まりない楽曲の数々も、それらに拍車をかけてくれている。（的田也寸志）

だが、この作品、私に不満だけを残させるような作品ではなかった。怪獣同士が対戦する怪獣映画としては、大変面白いではないか！　ゴジラを単なる餌の塊として見做し、大群で襲いかかって来るメガニューラ。コイツらを熱線で薙ぎ払うゴジラ。熱線を吐かんとするゴジラの背鰭にくっついていたメガニューラが背鰭から発する超高温の熱でボロボロになる哀れさ。水没した渋谷の底で
眠っているメガギラスの幼体にエネルギーを注入し、その生命が尽きてしまい
水面に浮上していくメガニューラたち。自分の知り得る攻撃を駆使して戦うゴジラとメガギラス。散々ゴジラを翻弄させたものの、不意を突かれゴジラの熱線を浴び散っていくメガギラスの最期。どのシーンも怪獣の魅力で溢れている

と思う。それと、ミリタリー描写もなかなかいい線いってると思う。
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　タイトルこそゴジラ×メガギラスですがその実、ゴジラと人間との戦いをじっくりとかつテンポよく描いた娯楽作品。静止衛星が真下に落下するなどという物理法則無視の脚本を歯切れいい映像と演出で乗り切ってしまった手塚監督に脱帽。

　クライマックスには思わず手に汗握りその結果に思わず拍手してしまった。金子監督の「ゴジラ・モスラ・キングギドラ」がその重厚さでダークな面での傑作ならば、本作はその対局ライトな面での傑作といえる。